在IT技术相当发达的21世纪，流程化管理在企业中具有举足轻重的地位。但凡事物发展都不可能一帆风顺，企业在流程管理中，进销存系统化管理总是遭遇以下三种实施困境：
困境一：企业的隐性成本持续增加
隐性成本是一种隐藏于企业总成本之中并游离于财务审计监督之外的成本，例如时间成本浪费、原料利用率低下等问题，并且类似的隐性成本在企业总成本中的比例还会随着企业的成长不断增大。企业变换着各式各样的方式试图解决这些问题，但其实问题的症结就在于流程不规范、职责不清晰、部门间无法有效沟通。企业必须明晰各职能部门的职责，在企业内部避免重复和无效作业，取消无关进销存流程，发现流程中的低效率时要及时制止、优化甚至变革，而流程E化进销存软件平台就是上述一切操作的基础，唯有一个科学、客观、高效的运行与监控平台存在，才能为企业获取成本优势提供持续的支持。
困境二：企业的流程管理缺乏长期保障
现在很多公司都进行了流程管理，这是很好的现象，说明企业开始重视流程管理了，但在几乎所有我提供过流程咨询服务的客户那里，都会发现这样的问题，即流程管理活动开展一段时间之后便无法继续下去，流程管理部门觉得没有方向了，流程绩效提升不明显了，人们又逐渐回到流程管理执行之前的松散状态了等等。这种现象，从本质上讲就是流程管理没有新平台！企业前期建立了初步的流程管理体系，但是却往往忽视了流程管理是闭环的，是波浪式前进螺旋式上升的过程。当企业流程管理进行到一定阶段就需要一个新的平台来支撑，这个平台的体现就是流程E化。当企业依托信息化平台来开展流程管理时，流程管理就会上升到一个新的更高层次的循环。
困境三：企业流程无法有效监控
在企业发展的信息中，唯有企业高层对市场信息了如指掌，对公司内部人员、生产、销售、财务等诸多方面掌控有力，才可能不断做出正确决策，不断扳正前进方向，推进企业健康发展。但传统管理模式之下，决策风险总难避免，误打误撞有时成效斐然，有时功亏一篑，关键问题就在于信息匮乏、信息不及时以及信息不对称，而流程E化就是这样一种可以将触角延伸至企业各个角落去攫取数据的信息化手段，帮助决策层解决信息占有不充分问题。比如，流程E化进销存软件能够实时获得业务流程的运行状态，并记录运行过程中的关键节点数据，支持所有运行结果的追朔分析，提供客观的分析依据，方便管理者找准问题对症下药；另外，有了流程E化进销存软件平台提供的数据，企业还可以通过仿真分析、权重计算等方法来评估企业业务流程，对设计不合理的流程及时进行调整。
对于上述企业流程管理困境，秘奥软件认为，简单一点来说，业务流程监控的目标是提供当企业的业务环境发生变化时能够及时了解业务事件的能力，这样才能保证做出及时和准确的决策。而流程E化进销存软件是实现业务流程监控的最佳工具，通过提供实时信息，可以减少决策成本、加速执行进程，从而使企业具备了敏捷型企业所要求的素质，能够快速地响应市场变化，快速地调整业务策略，快速地实施业务流程，同时根据秘奥进销存软件反馈的信息对业务流程进行快速地优化调整。